2009年7月3日，院所第三届五次职工代表大会胜利召开。正式代表101人，列席代表和特邀代表44人参加了会议。院所副高职以上人员听取了赵平院所长的工作报告。院校党委副书记林长胜同志和北京教育工会主席张青山同志到会讲话，并祝大会取得圆满成功。会议由院所党委副书记付凤环同志和院所工会副主席蔡建强同志主持。
　　大会在嘹亮的《国歌》声中开幕。首先由赵平院所长作院所工作报告。报告从医疗、科研、教育、国际交流、管理、基本建设与后勤保障、全力做好奥运会、残奥会的医疗卫生保障工作、医院文化及精神文明建设等八个方面对院所的工作进行了全面的回顾总结，对2009年院所工作提出了总体要求和奋斗目标。赵院长在工作报告中指出：2008年，是充满挑战和希望的一年，在举国上下欢庆29届北京奥运会胜利召开的同时，院所迎来了五十华诞。在党的十七大精神指引下，院所以五十年为新的起点，深入学习实践科学发展观，求真务实，开拓进取，牢记为人民健康服务的根本宗旨，继续解放思想，狠抓医疗质量，提高服务效率，医疗、科研、教学、管理等工作均呈现出全面持续发展的喜人势头。2009年是深入贯彻“十七大”和十七届三中全会精神，全面落实实践科学发展观的一年，同时也是深化医疗卫生体制改革全面启动和整体推进的一年。院所将坚持以科学发展观统领全局，保证医疗安全、提高医疗质量、控制医药费用、提高服务效率，为实现医疗体制改革的总体目标提供有力支持；同时抓住机遇，积极筹建国家癌症中心，坚持医、教、研、防四位一体发展方向；加快向研究型院所转型的步伐，不断探索院所可持续发展的长效机制，真正做到内抓管理、外树形象，促进院所稳步、持续、健康、和谐发展，为提高人民健康，构建和谐社会而努力。
　　全体职工代表还认真听取了院所总会计师徐元元同志关于院所财务工作的报告；提案委员会主任沈惠芝同志关于提案工作的报告；党委办公室主任吕春梅同志关于《职能部门负责人测评》的说明；院所控烟小组邹小农教授《关于肿瘤院所执行全国医疗卫生系统全面禁烟决定的实施条例的说明》，与会代表全体举手表决通过该项决定。代表们对院所３６位职能部门负责人进行了民主评议，马玉林副院所长宣布了职能部门负责人的测评结果。
　　在分组讨论中，代表们就大会的各项工作报告及议题进行了认真热烈的讨论，大家认为，虽然在过去的一年中院所工作有了稳步的发展，但面临的压力和困难还是巨大的，我们要紧扣时代脉搏，把握机遇，勇于挑战，不断开拓创新，扎扎实实抓好院所各项工作的落实，认真总结工作中的经验教训，为院所更加美好的明天而努力工作。之后，院所领导班子现场接受了职工代表的质询。
　　院所党委书记董碧莎同志在大会的总结发言中说，职代会在院所的民主管理和民主监督工作中，在医、教、研、防工作中起着积极有效的促进作用，职工代表们要将这次大会的精神传达下去，落实大会的各项工作任务和工作目标，带领广大职工齐心协力为院所的发展努力工作。
　　大会自始至终在团结、民主、务实、进取的气氛中进行，在《团结就是力量》的歌声中胜利闭幕。（工会 马晓劲）